Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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