Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms