Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a6B1AVK5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms