Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Spocd1B1ASB6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms