Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms