Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms