Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms