Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms