Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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