Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms