Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Lcn6A2AJB9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Lcn6A2AJB9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn6A2AJB9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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