Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms