Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-BlV9GXR0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms