Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Top3bQ9Z321 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms