Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms