Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn6Q9Z262 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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