Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap3b1Q9Z1T1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.8 ms