Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lgr5Q9Z1P4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lgr5Q9Z1P4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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