Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd6ipQ9WU78 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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