Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf4Q9QZS2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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