Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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