Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VapbQ9QY76 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms