Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Kcnip3Q9QXT8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Kcnip3Q9QXT8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Kcnip3Q9QXT8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnip3Q9QXT8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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