Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trim44Q9QXA7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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