Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms