Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms