Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms