Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms