Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms