Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba8Q9JJZ2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms