Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms