Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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