Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms