Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tlr1Q9EPQ1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Tlr1Q9EPQ1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Tlr1Q9EPQ1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Tlr1Q9EPQ1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Tlr1Q9EPQ1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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