Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnft1Q9DCN7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnft1Q9DCN7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rnft1Q9DCN7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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