Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms