Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms