Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf580Q9DB38 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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