Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ift43Q9DA69 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ift43Q9DA69 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms