Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms