Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms