Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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