Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms