Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms