Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms