Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ribc2Q9D4Q1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ribc2Q9D4Q1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms