Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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