Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms