Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms