Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms